應用奈米科技2011年通過ISO9001-2008認證；於2017年通過ISO9001-2015認證，整體運作架構與品質管理和世界接軌。並擁有TAF認證「應用奈米實驗室 (編號3363)」，不僅確保量測檢驗數據正確性且能出具國際認可檢測報告，提昇生產流程品質與效率。在2021年進一步通過ISO14001-2015認證，持續對企業治理和對環境自覺及管理精進。