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磁流體軸封的外殼以非磁性不銹鋼材料製作，以屏蔽磁力對附近的電磁元件的影響。在使用磁流體軸封時，必需注意週圍20公分以內的電磁元件佈局。外在的強力磁場，也可能影響磁流體軸封
之正常運作。
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長時間靜置的磁流體軸封，在進入施加壓力差及全速運轉前，必須先行轉動數圈，讓磁流體在磁場中能均勻分佈，以延長磁流體軸封的使用壽命。
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初次使用經長時間靜置的磁流體軸封，轉軸因為磁流體中磁性微粒的有序排列，磁性增強，會較平常時難以轉動。在進入正常運轉前，必須先行轉動一、二圈，增加磁性微粒的亂度，以降低磁性及轉動之轉矩。訂定驅動馬達規格時，請注意其啟動轉矩要在4
kgf˙cm以上。
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磁流體軸封因應不同環境之需求，會有不同基礎載液的磁流體。一般用於真空軸封的磁流體，不能用於流體或化學蒸氣的密封。如有特殊的環境需求，必需選用不同化學特性的磁流體。
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軸封兩側的軸承，通常是高速轉動下的熱源所在。為保持磁石的永久磁性，切勿超過規格的最高轉速。較常溫為高的大氣溫度，會降低磁石在高速轉動下的耐
溫程度。
